После распада в 1997 году «Наутилуса» Вячеслав Бутусов на протяжении нескольких лет выступал сольно, на концертах сотрудничал с Юрием Ильченко, минской группой «Плато», театром «Лицедеи» и многими другими артистами. В то время он подружился с Юрием Каспаряном и стал приглашать его на свои студийные сессии, таким образом, вместе они записали и выпустили два альбома: Незаконнорожденный альхимик доктор Фауст — пернатый змей (1997) и Звёздный падл (2000). В июне 2001 года Бутусов завершил акустическое турне «Тихие игры» и стал задумываться о создании полноценного электрического состава. В октябре сформировался костяк новой группы, в которую вошли гитарист Каспарян и клавишник Сакмаров, партии бас-гитары подрядился исполнять сам Бутусов. Для поисков барабанщика объявили кастинг, и в итоге эту вакансию занял Евгений Кулаков, успевший поиграть со многими питерскими группами, такими как «Департамент», «Флирт», «Фрукты», «Wine», «Радио», «Облаком», «Петля Нестерова», «El Coyotes», «Пойманные муравьеды», «Traffix» и «1,5 кг отличного пюре».

Группа (ещё без названия) была представлена 11 октября 2001 года, а в ноябре под названием «Ю-Питер» записала свой первый сингл Ударная любовь. Первый концерт прошёл 24 января 2002 года в ДК Горбунова. В течение 2002 года группа активно гастролировала по России и ближнему зарубежью, исполняя в основном песни периода сольного творчества Вячеслава Бутусова, а также хиты групп «Наутилус Помпилиус» и «Кино». В июне состоялось триумфальное выступление на фестивале «Окна открой!»

В марте 2003 года была завершена работа над первым номерным альбомом Имя рек, в него вошли одиннадцать новых песен Бутусова, которые вскоре стали основой концертной программы группы. В течение 2003 года «Ю-Питер» принял участие в нескольких рок-фестивалях, записал песню «Сурги и Лурги» для трибьют-альбома группы «Пикник». В декабре коллектив лишился Олега Сакмарова, накопившего к тому времени собственный материал и пожелавшего основать отдельную группу.

В июне-августе 2004 года при участии композитора и аранжировщика Евгения Курицына группа записала альбом Биографика, треки из которого — «Песня идущего домой» и «Девушка по городу» активно ротировались в радиоэфире. На телевидении регулярно транслировался клип «Девушка по городу», режиссёром которого выступил Дмитрий Киселёв, ранее занимавший монтажом фильмов («Ночной дозор») и съёмками рекламных роликов.

В 2008 году, перед фестивалем «Нашествие» в группе появился новый участник — бас-гитарист Сергей Вырвич, известный по игре в группах C.O.K., bzik и Billy’s Band.

В 2008 году вышел альбом Богомол, песня «Скажи, мне птица» попала в эфир российских радиостанций. В том же году выходит сдвоенный трибьют-альбом группы Наутилус Помпилиус. Во второй части собраны песни Наутилуса, исполненные группой Ю-Питер.

11 октября 2009 года состоялся концерт в концертном зале «Октябрьский». Концерт посвящён 25-летию группы «Nautilus Pompilius». Уникальность этого концерта в том, что несколько композиций прозвучало в сопровождении камерного оркестра. Телеверсия концерта была показана на «Пятом канале».

Группа гастролирует с концертами по России и миру.

В июне 2010 года на студии «Добролет» группа записала новый альбом, который вышел осенью под названием «Цветы и тернии». Альбом выйдет на виниловых пластинках. Также была записана песня «Дети минут» на стихи Виктора Цоя, которая войдет в саундтрек фильма «Игла.Remix» и активно ротируется в радиоэфире.

В начале 2011 группу покинул бас-гитарист группы Сергей Вырвич. Вместо него был взят Алексей Андреев, ранее выступавший в петербургском коллективе «HALF DUB THEORY».

Участники:

•     Вячеслав Бутусов — вокал, гитара (до прихода Вырвича бас-гитара)
•     Юрий Каспарян — гитара.
•     Алексей Андреев — бас-гитара
•     Евгений Кулаков — ударные.

Бывшие участники:

•     Олег Сакмаров — клавишные, духовые.
•     Сергей Вырвич — бас-гитара.